Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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HOXD13P35453 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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HOXD13P35453 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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HOXD13P35453 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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HOXD13P35453 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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HOXD13P35453 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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HOXD13P35453 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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HOXD13P35453 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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HOXD13P35453 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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HOXD13P35453 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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HOXD13P35453 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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HOXD13P35453 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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