Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN7P35236 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN7P35236 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN7P35236 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN7P35236 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN7P35236 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN7P35236 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN7P35236 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN7P35236 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN7P35236 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN7P35236 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms