Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFNP31947 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFNP31947 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFNP31947 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFNP31947 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFNP31947 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFNP31947 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFNP31947 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFNP31947 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFNP31947 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFNP31947 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFNP31947 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFNP31947 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFNP31947 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFNP31947 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SFNP31947 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFNP31947 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms