Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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