Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPIFP30405 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PPIFP30405 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPIFP30405 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPIFP30405 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPIFP30405 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPIFP30405 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPIFP30405 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPIFP30405 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PPIFP30405 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPIFP30405 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPIFP30405 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPIFP30405 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPIFP30405 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPIFP30405 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPIFP30405 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPIFP30405 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms