Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD34P28906 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD34P28906 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms