Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMLP26374 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMLP26374 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMLP26374 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMLP26374 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms