Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCP25054 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCP25054 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCP25054 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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