Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms