Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms