Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPI1P17947 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPI1P17947 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms