Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00032P0C843 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00032P0C843 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00032P0C843 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00032P0C843 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00032P0C843 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00032P0C843 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00032P0C843 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00032P0C843 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00032P0C843 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00032P0C843 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00032P0C843 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00032P0C843 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00032P0C843 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00032P0C843 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00032P0C843 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms