Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F6O75461 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms