Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms