Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC37.51■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ABCC9O60706 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms