Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms