Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNB1O43157 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms