Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CCDC179H3BU77 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms