Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms