Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SDR42E2A6NKP2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDR42E2A6NKP2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms