Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
A4D1N5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
A4D1N5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
A4D1N5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
A4D1N5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
A4D1N5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
A4D1N5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.36
A4D1N5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
A4D1N5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
A4D1N5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
A4D1N5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
A4D1N5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
A4D1N5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
A4D1N5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
A4D1N5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
A4D1N5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
A4D1N5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
A4D1N5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms