Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCE3A1L190 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms