Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 DHX8-202ENST00000540306 3809 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 SCML2-201ENST00000251900 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-9Q9BYP9 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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KRTAP9-9Q9BYP9 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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KRTAP9-9Q9BYP9 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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KRTAP9-9Q9BYP9 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010332.1-201ENST00000620439 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 PALB2-201ENST00000261584 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
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