Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
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