Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms