Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SNX13Q9Y5W8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SNX13Q9Y5W8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SNX13Q9Y5W8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SNX13Q9Y5W8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SNX13Q9Y5W8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SNX13Q9Y5W8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SNX13Q9Y5W8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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