Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2J1Q9Y385 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms