Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms