Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV3

ACIN1, Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACIN1Q9UKV3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ACIN1Q9UKV3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACIN1Q9UKV3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACIN1Q9UKV3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACIN1Q9UKV3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACIN1Q9UKV3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACIN1Q9UKV3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACIN1Q9UKV3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACIN1Q9UKV3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACIN1Q9UKV3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACIN1Q9UKV3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACIN1Q9UKV3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACIN1Q9UKV3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACIN1Q9UKV3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACIN1Q9UKV3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACIN1Q9UKV3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms