Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCTN4Q9UJW0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCTN4Q9UJW0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms