Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRP68Q9UHB9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms