Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms