Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMLHEQ9NVH6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms