Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms