Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDC42SE2Q9NRR3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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