Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263 ms