Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN3Q9NQT6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms