Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INCENPQ9NQS7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms