Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms