Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms