Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMG20AQ9NP66 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms