Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPESC1Q9GZL8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms