Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CIPCQ9C0C6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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