Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms