Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS2Q9BVG9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms