Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT17Q9BSW7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT17Q9BSW7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT17Q9BSW7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT17Q9BSW7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT17Q9BSW7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT17Q9BSW7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT17Q9BSW7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT17Q9BSW7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT17Q9BSW7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms