Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PKP4Q99569 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms