Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIN3AQ96ST3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SIN3AQ96ST3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms