Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCT8L2Q96SF2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCT8L2Q96SF2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms