Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms